システム生物学の研究を投稿する
遺伝子制御、タンパク質相互作用、細胞経路解析の分野で画期的な発見を発表している、第一線の分子生物学者やシステム研究者の仲間に加わりませんか
2つの便利な投稿方法
ご自身のワークフローに最も適した投稿方法をお選びください。どちらの方法でも、査読プロセス全体を通じた編集部の支援のもと、原稿は安全かつ効率的に取り扱われます。
ManuscriptZoneポータル
投稿を完全に管理し、リアルタイムで追跡したい研究者のために設計された、総合的な原稿管理システムです。
- 自動保存機能によりデータの消失を防止
- 投稿状況をリアルタイムで確認
- 査読者のコメントに直接アクセス
- 段階的なガイド付きの投稿手順
- 安全な文書管理
- 修正履歴の追跡とバージョン管理
簡易投稿フォーム
アカウントを作成せずに、より迅速で簡単な手続きを希望する場合の、シンプルな投稿のための効率的な代替手段です。
- アカウント登録は不要
- シンプルな1ページの投稿フォーム
- 完成した原稿の迅速なアップロード
- シンプルな投稿に最適
- 受領時にメールで確認
- 追跡のためにManuscriptZoneへ移行
掲載する原稿の種類
Journal of Systems Biologyは、分子メカニズム、細胞システム、生物学的ネットワークの理解を深める多様な投稿を歓迎します。本誌の専門家である査読者は、システムレベルの解析と分子生物学の方法論を専門としています。
原著論文
遺伝子発現解析、タンパク質間相互作用、代謝経路モデリング、細胞過程のシステムレベルの研究に関する包括的な研究。
方法・プロトコル
システム生物学研究とオミクスデータ解析のための新しい実験手法、計算アルゴリズム、バイオインフォマティクスパイプライン、解析手法。
システム解析の総説
分子経路、制御ネットワーク、マルチオミクス統合のアプローチ、生物学的現象のシステムレベルの理解に関する包括的な総説。
計算モデル
複雑な生物システムと分子動態を理解するための数理モデル、ネットワークシミュレーション、予測アルゴリズム、計算フレームワーク。
データリソース
システム生物学研究と分子研究を支える大規模データセット、オミクスデータベース、注釈付き生物学的ネットワーク、キュレーションされたリソース。
短報
分子メカニズムにおける重要な知見、システムレベルの予備的な発見、迅速な発信が必要な時宜を得た観察の速報。
研究対象範囲と重点分野
本誌は分子生物学へのシステムレベルのアプローチを専門とし、生物学的ネットワークと分子メカニズムの統合的解析を重視しています。
遺伝子制御ネットワーク
転写制御、エピジェネティック修飾、クロマチン動態、遺伝子発現の制御機構
タンパク質相互作用ネットワーク
タンパク質複合体、シグナル伝達カスケード、翻訳後修飾、プロテオーム全体の相互作用マッピング
代謝システム
代謝フラックス解析、経路の再構築、酵素反応速度論、メタボロームプロファイリング
マルチオミクスの統合
包括的なシステム理解のための、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、プロテオミクス、メタボロミクスの統合
細胞シグナル伝達
シグナル伝達経路、受容体の動態、セカンドメッセンジャー、クロストークの機構
計算生物学
ネットワークモデリング、機械学習の応用、予測アルゴリズム、バイオインフォマティクスツール
投稿前チェックリスト
Ensure your manuscript meets these requirements before submission to support a smooth review process:
明確なセクション見出しと適切な書式を備えたWord（.docx）またはLaTeXファイル
TIFFまたはEPS形式、解像度300 DPI以上、内容を表す説明文による適切なラベル付け
オミクスデータを公開リポジトリ（GEO、ProteomeXchange、MetaboLights）に登録し、アクセッション番号を記載
ヒトを対象とする研究または動物研究に関するIRB／IACUCの承認書類
全著者が原稿を承認し、投稿に同意していること
金銭的および非金銭的な利益相反の申告
計算スクリプトと解析コードをGitHubまたはZenodoに登録
VancouverまたはAPAスタイルによる完全な引用（入手可能な場合はDOIを付記）
Peer Review Process
Our transparent, efficient peer review process ensures rigorous evaluation by systems biology experts.
初期スクリーニング
編集チームが原稿の対象範囲、質、完全性を確認します。剽窃チェックはiThenticateソフトウェアを使用して行います。
3日担当編集者の割り当て
最適な評価のため、原稿は、システム生物学研究の該当分野に専門知識を持つ編集者に割り当てられます。
査読
分子生物学とシステム的アプローチに関する専門知識を持つ査読者が、方法、結果、結論を評価します。
編集上の判定
編集者が査読者のフィードバックを総合し、建設的なフィードバックとともに、採択、軽微な修正、大幅な修正、または不採択の判定を下します。
修正と再査読
著者は査読者のコメントに対応した修正原稿を提出します。元の査読者による再査読で、懸念が適切に解消されたことを確認します。
制作と出版
採択された原稿は、原稿整理、組版、著者による最終校正を経て、直ちにオープンアクセスで出版されます。
Publication Process
Every manuscript receives the same rigorous peer review; editors aim to communicate decisions promptly.
システム生物学者に本誌が選ばれる理由
専門分野に特化した索引収録
Google Scholarへの収録により、皆さまの研究は世界的な可視性を得て、世界の科学コミュニティとつながります。
専門の査読者
オミクス解析、ネットワークモデリング、分子メカニズムの専門知識を持つ、現役のシステム生物学研究者による査読
グローバルなオープンアクセス
購読の障壁がなく公開直後から世界中で閲覧でき、論文のインパクトと引用の可能性を最大限に高めます。
倫理基準
COPEの出版倫理、透明性のある査読、厳格な基準を遵守しています。研究不正の申し立てには真摯かつ公正に対応します。
APCの免除が利用可能
低所得国の研究者および研究資金のない研究に対して、ご要望に応じて経済的支援を行います。
原稿作成のガイドライン
原稿の構成
明確さとインパクトを最大限に高めるため、システム生物学の研究は以下の推奨構成に従ってまとめてください：
- タイトル：簡潔かつ内容を的確に表すもので、研究対象とした主要な分子システムまたは経路を含めます
- 要旨：目的、方法、主な知見およびシステムレベルでの意義をまとめた250-300語
- キーワード：特定の分子過程、方法論および生物学的システムを含む5-8個
- 序論：対象とする生物学的システムの背景、現在の知見の空白および研究目的
- 材料と方法：詳細な実験プロトコル、計算手法、統計解析およびデータ処理パイプライン
- 結果：ネットワーク図、パスウェイマップまたはオミクスデータを示す適切な図を用いた、知見の明確な提示
- 考察：システムの文脈における結果の解釈、既存モデルとの比較およびより広い意義
- 結論：分子メカニズムおよびシステムレベルの理解に関する主要な知見
- データの利用可能性：オミクスデータセットおよび計算コードのリポジトリのアクセッション番号
- 参考文献：関連するシステム生物学および分子生物学の文献の網羅的な引用
図表
システム生物学の研究には、質の高い視覚的表現が不可欠です：
- ネットワーク図では、ノード、エッジおよび相互作用の種類を明確に示すようにしてください。
- パスウェイマップには、遺伝子／タンパク質名と制御関係を含める必要があります。
- ヒートマップには、適切なカラースケールと階層的クラスタリングの樹形図が必要です。
- すべてのオミクスデータの可視化には、適切な統計的注釈が必要です。
- 図は個別の高解像度ファイル（TIFF/EPS、300 DPI以上）として提出してください。
研究を投稿する準備はできましたか？
当ジャーナルの編集チームは、投稿から査読までの過程を通じて皆さまをサポートします。技術的なサポートや原稿の準備に関するご質問は、サポートチーム（[email protected]）までお問い合わせください。
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