原著論文
目的、方法、結果、考察、結論で構成された原稿。
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著者の投稿基準
投稿規定
投稿規定
Journal of Systems Biology
効率的な査読のために、再現可能な方法、明確な構成、ポリシーに準拠した報告で原稿を作成してください。
厳格な査読基準
EfficientOnline Publication
グローバルな研究コミュニティ
オープンアクセス出版
対象範囲への適合
投稿前のご案内
初期選別の迅速化と査読者の割り当ての質の向上のため、アップロード前に対象範囲と構成を確認してください。
Journal of Systems Biologyは、システムモデリング、ネットワーク生物学、マルチオミクスの統合、トランスレーショナル解析、実装科学に関する研究を掲載しています。
著者は科学的な貢献を明確に述べ、発見、開発、または臨床へのトランスレーションに対する実践的な意義を説明してください。
質の高い投稿は、知見を設計、特性評価、安全性、有効性、または展開の過程における意思決定のポイントに結び付けています。
学際的な原稿では、解釈可能性と再現性を高めるため、各分野の貢献を明確にしてください。
新しい方法を導入する研究では、独立した評価に十分な検証の論理とベンチマークの背景を記載してください。
本誌の対象範囲外の投稿は、編集上の焦点を保つため、初期選別の段階で他誌への投稿を案内されるか不採択となる場合があります。
論文の種類
正しい原稿形式の選択
形式の選択は、エビデンスの成熟度と方法論の深さに合わせてください。
方法論またはプロトコル論文
検証と境界条件を含む、再現可能な詳細なワークフロー。
システマティックレビュー／メタアナリシス
透明性のある検索戦略、組み入れの論理、統合の方法。
トランスレーショナル研究
探索段階の知見を前臨床または臨床での有用性に結び付けるエビデンス。
短報
簡潔な方法論と限定された主張による、焦点を絞った知見。
パースペクティブとコメンタリー
新たなシステム生物学研究の優先課題について、エビデンスに基づく解釈を示すもの。
論文種別を選択する際は、簡潔さよりも方法論の明確さを優先してください。複雑なデータセットには詳細な報告が必要です。
適合性に確信が持てない場合は、投稿前にエディトリアルオフィスにお問い合わせいただければ、迅速にご案内いたします。
原稿の構成
報告の基本要件
一貫した構成は、査読者が妥当性、再現性、トランスレーショナルな関連性を効率的に評価するのに役立ちます。
- タイトルは正確で、主要な成果またはイノベーションの主張を反映したものにしてください。
- 要旨は、目的、方法、主な結果、結論で構成してください。
- 緒言では、誇張せずにエビデンスのギャップと根拠を明確にしてください。
- 方法には、サンプリング、統合、モデリング、解析について再現可能な詳細を記載してください。
- 結果では、主要な知見と副次的な知見を区別し、不確実性を明確に報告してください。
- 考察では、限界と実践的な意義を含めて知見を解釈してください。
- 結論は、研究デザインの強さとエビデンスの範囲に見合ったものにしてください。
図と表は原稿の主張と一致していなければならず、完全な説明文と単位の定義を含める必要があります。
探索的解析を含める場合は、事前に規定したアウトカムと明確に区別してください。
倫理と研究公正
必須のポリシー関連開示事項
編集上の評価と最終的な採択には、研究公正とコンプライアンスに関する情報が必要です。
倫理審査の承認
ヒトおよび動物を対象とする研究では、監督機関による承認とプロトコル識別番号を報告しなければなりません。
同意とプライバシー
該当する場合は、同意の手続きとプライバシー管理を文書化しなければなりません。
利益相反の開示
すべての著者は、関連する金銭的および非金銭的な利害関係を開示してください。
研究資金の透明性
研究資金源と、デザインおよび解析におけるスポンサーの役割を明示しなければなりません。
データとコードに関する記載
利用可能性の詳細には、保管場所、アクセス条件、制限事項を含めてください。
画像とデータの完全性
報告する結果は、誤解を招く加工のない元データを反映していなければなりません。
研究公正に関する注意：開示されていない重複、不適切に加工・改変された図版、一貫性のないデータ報告は、正式な審査の対象となる場合があります。
ファイルと書式
投稿書類のチェックリスト
ファイルが揃っていると編集処理が円滑になり、修正サイクルが減ります。
- セクション構成と用語が一貫した原稿本文ファイル。
- 全著者の詳細と責任著者の連絡先を記載したタイトルページ。
- 出版品質で作成され、明確な説明文を付けた図と表。
- 新規性、対象範囲への適合、ポリシーの遵守をまとめたカバーレター。
- プロトコル、詳細な方法、追加解析のための補足ファイル。
- 読みやすさを高めるため、投稿前に言語面の校閲を完了してください。
その後の引用リンクを支えるため、参考文献の書式は完全かつ正確にしてください。
コホート、経路、特徴量セット、エンドポイントの定義の名称は、すべてのファイルで統一してください。
査読プロセス
投稿後の流れ
査読の各段階を理解しておくと、チームは効率的で質の高い修正対応を準備できます。
編集部による初期選別
外部査読に回す前に、対象範囲、研究公正、報告の準備状況を確認します。
査読者の選定
専門家は、分野との関連性と方法論の専門知識に基づいて選定されます。
判定の通知
編集者は、焦点を絞った根拠と優先順位を付けた修正要件を示します。
修正版の投稿
著者は、査読者の指摘を原稿の具体的な修正箇所に対応させてください。
最終評価
編集者は、科学面とポリシー面の懸念が完全に解消されたかどうかを評価します。
制作ワークフロー
採択された論文は、原稿整理、メタデータ作成、出版日程の調整に進みます。
修正への回答は、特に解釈に相違がある場合でも、エビデンスに焦点を当てた専門的なものにしてください。
明確な対応表は、査読者と編集者が修正内容を迅速かつ公正に確認するのに役立ちます。
投稿の計画
採択に向けた準備を整えるための実務上の注意点
最終アップロードの前に、以下の実務上の注意点を活用して、明確さ、ポリシーとの整合性、査読の効率を高めてください。
編集計画のポイント：アップロード前に、要旨の主張、図、結論の記述の一貫性を確認してください。この方法により、編集者と査読者は厳密さを損なうことなく原稿をより迅速に評価できます。
著者向けワークフローのご案内：複雑な方法のセクションには、合成、特性評価、解析のワークフローについて再現可能な詳細を含めてください。この手順を早期に行うチームは、通常、修正時の手間を減らし、出版スケジュールを守ることができます。
品質向上のための注意：回答書は、査読者の指摘を原稿の具体的な修正箇所に対応させたときに最も説得力が増します。同じ方法により、メタデータの品質と、その後の索引収録における発見されやすさも向上します。
投稿戦略のポイント：実験デザインが因果推論ではなく関連の推論を支持する場合は、因果関係について過度な主張をしないでください。これにより、判定の透明性が高まり、査読に関するやり取りもより効率的になります。
出版準備に関するご注意：統計と結果のセクションでは、事前に規定した解析と探索的解析を明確に区別してください。これにより、原稿の主要部分と補足ファイルとの一貫性が向上します。
運用上の推奨事項：構造化されたカバーレターは、編集部による初期選別と査読者の割り当ての精度を高めます。また、機関、トランスレーショナル研究、エビデンス統合の読者からの信頼も高まります。
査読者向けの明確化に関する注意：モデル、経路、マルチオミクスの報告では、セクション間で用語を統一することが不可欠です。この方法により、編集者と査読者は厳密さを損なうことなく原稿をより迅速に評価できます。
制作計画のご案内：投稿規定に沿った準備にあたっては、主張がデータの強さに見合ったものになるよう結論の表現を引き締め、データとコードの利用可能性に関する記載がポリシーの文言と一致していることを確認してください。これにより、その後の索引収録の品質と検索での適合性が向上します。
編集計画のポイント：投稿規定に沿った準備にあたっては、タイトル、要旨、キーワードの表現を主要なエビデンスに基づく主張と一致させ、表、図、本文の記述の一貫性を確認してください。これにより制作段階での手戻りが減り、公開スケジュールが守られます。
著者向けワークフローのご案内：投稿規定に沿った準備にあたっては、主要な結果のそれぞれを明確な方法の記述と再現性に関する注記に対応させ、表、図、本文の記述の一貫性を確認してください。これにより制作段階での手戻りが減り、公開スケジュールが守られます。
品質向上のための注意：投稿規定に沿った準備にあたっては、事前に規定した解析と探索的な知見を追跡可能な形で区別し、データセットやスクリプトが時間とともに変わる可能性がある場合はバージョンに関する注記を残してください。これにより、トランスレーショナル研究やエビデンス統合の読者からの信頼が高まります。
投稿戦略のポイント：投稿規定に沿った準備にあたっては、図の説明文、単位の定義、補足資料の参照を一致させ、データセットやスクリプトが時間とともに変わる可能性がある場合はバージョンに関する注記を残してください。これにより、トランスレーショナル研究やエビデンス統合の読者からの信頼が高まります。
出版準備に関するご注意：投稿規定に沿った準備にあたっては、最終アップロードの前に開示、研究資金、倫理に関する記載を確認し、すべての原稿ファイルで用語を統一してください。これにより、通常、初期選別での判断の確度と査読者の割り当ての精度が向上します。
運用上の推奨事項：投稿規定に沿った準備にあたっては、査読者への回答に伴う変更を原稿の正確な箇所と対応させて記録し、すべての原稿ファイルで用語を統一してください。これにより、通常、初期選別での判断の確度と査読者の割り当ての精度が向上します。
査読者向けの明確化に関する注意：投稿規定に沿った準備にあたっては、制作の確定前にメタデータ項目と著者識別子を確認し、解釈上の判断に用いた運用上の閾値を定義してください。これにより、修正サイクル中の避けられる確認のやり取りが減ります。
制作計画のご案内：投稿規定に沿った準備にあたっては、主張がデータの強さに見合ったものになるよう結論の表現を引き締め、解釈上の判断に用いた運用上の閾値を定義してください。これにより、修正サイクル中の避けられる確認のやり取りが減ります。
Editorial planning insight: For instructions for author planning, align title, abstract, and keyword language with the primary evidence claim; state practical limitations and boundary conditions explicitly. This supports cleaner editorial decisions.
Author workflow guidance: For instructions for author planning, map each major result to a clear methods description and reproducibility note; state practical limitations and boundary conditions explicitly. This supports cleaner editorial decisions.
品質向上のための注意：投稿規定に沿った準備にあたっては、事前に規定した解析と探索的な知見を追跡可能な形で区別し、データとコードの利用可能性に関する記載がポリシーの文言と一致していることを確認してください。これにより、その後の索引収録の品質と検索での適合性が向上します。
投稿戦略のポイント：投稿規定に沿った準備にあたっては、図の説明文、単位の定義、補足資料の参照を一致させ、データとコードの利用可能性に関する記載がポリシーの文言と一致していることを確認してください。これにより、その後の索引収録の品質と検索での適合性が向上します。
出版準備に関するご注意：投稿規定に沿った準備にあたっては、最終アップロードの前に開示、研究資金、倫理に関する記載を確認し、表、図、本文の記述の一貫性を確認してください。これにより制作段階での手戻りが減り、公開スケジュールが守られます。
運用上の推奨事項：投稿規定に沿った準備にあたっては、査読者への回答に伴う変更を原稿の正確な箇所と対応させて記録し、表、図、本文の記述の一貫性を確認してください。これにより制作段階での手戻りが減り、公開スケジュールが守られます。
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編集長
