Journal of Respiratory Diseases

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Journal of Respiratory Diseases – データアーカイブと許諾

オープンアクセス・査読付き

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データアーカイブと許諾

呼吸器医学研究における透明で責任あるデータ共有を支援します。

FAIRデータ見つけやすく、アクセス可能で、相互運用可能なデータ。
患者のプライバシー機密性の高い診療記録を保護します。
コードの透明性パイプラインとスクリプトを共有します。
長期保存安定したリポジトリとメタデータ。

ジャーナルの概要

ISSN: 2642-9241
DOIプレフィックス: 10.14302/issn.2642-9241
ライセンス: CC BY 4.0
査読付きオープンアクセスジャーナル

対象範囲との適合

呼吸器内科学、気道疾患、呼吸器感染症、集中治療、睡眠医学およびトランスレーショナル治療。本誌は、検証された臨床的およびメカニズムに関するエビデンスを重視します。

出版モデル

オープンアクセス、シングルブラインド方式の査読、採択および制作チェック後の迅速な出版。メタデータの検証とDOI登録が含まれます。

データアーカイブと許諾

JRDは、呼吸器医学および呼吸器研究におけるオープンで責任あるデータ共有を支援しています。著者は、可能な場合は、明確なアクセス方法を添えて、データとコードを信頼できるリポジトリに登録するべきです。

臨床データセットは、患者のプライバシー、同意、または規制上の制約により、アクセス管理が必要となることを認識しています。著者は、制限事項とアクセス方法を記録してください。

推奨リポジトリ
  • Zenodo、Figshare、Dryadなどの汎用データリポジトリ
  • アクセス制御およびデータ利用契約を伴う臨床データセットおよびコホートデータセット
  • GEOやArrayExpressなどのゲノミクスおよびトランスクリプトミクスのリポジトリ
  • ProteomeXchangeなどのプロテオミクスのリポジトリ
  • リリースタグを付したGitHubやGitLabなどのコードリポジトリ
機微なデータとプライバシー

患者の識別情報は削除しなければならず、データは適用されるプライバシー規制に従って匿名化されるべきです。完全な共有ができない場合は、匿名化した要約とアクセス申請の明確な手順を提供してください。

著者は、データ管理者、アクセス審査の手続き、同意の範囲を含め、データガバナンスについて記録すべきです。

データおよびコードの利用可能性に関する声明
  • 原稿にリポジトリへのリンクまたはアクセッション番号を記載する
  • 該当する場合は、データおよびコードのライセンス条件を明記する
  • 独自のスクリプトまたはパイプラインについて説明文書を提供する
  • アクセス制限および承認要件があれば記述する
推奨ファイル形式
データの種類 推奨形式 備考
臨床データセット CSV, TSV データ辞書を含める
画像データ DICOM, NIfTI 取得プロトコルを提供する
ゲノミクス/オミクス FASTQ, BAM, VCF パイプラインの詳細を含める
組織学/生検 TIFF, SVS 染色プロトコルを含める
アーカイブのチェックリスト
  • データセットのメタデータが完全かつ一貫している
  • リポジトリのアクセッション番号が記載されている
  • コードとパイプラインが文書化されている
  • 倫理承認および許可が参照されている
  • アクセス制限が明確に記載されている
  • 臨床データセットが匿名化されており、プライバシー規制に準拠しているかどうかを明記してください。
  • 登録したデータセットのリポジトリDOIまたはアクセッション番号を提供する。
  • 再利用と相互運用性を可能にするために使用したメタデータ標準を記述してください。
  • 画像データセットに取得パラメータとプロトコルが含まれているかどうかを明確にしてください。
  • 機密性の高い記録および生体試料に対するアクセス管理を報告してください。
  • 解析スクリプトまたは統計モデルのコードリポジトリへのリンクを記載してください。
  • 研究資金提供者または共同研究者が求めるエンバーゴ(公開猶予)期間をすべて記載してください。
  • データ共有の例外について説明し、データが制限される場合はその理由を示してください。
  • バイオバンクまたは臨床レジストリのガバナンスを記録してください。
  • 主要アウトカムについて、データ辞書または変数の定義を提供してください。
  • 縦断コホートにおけるデータのバージョン管理と更新手順を記述してください。
  • 画像データまたはオミクスデータをどのように匿名化し、保存したかを明記してください。
  • データセットと原稿の表または図との対応関係を明確に示してください。
  • オミクスデータセットおよび解析パイプラインのアクセッション番号を記載してください。
  • 臨床検査アッセイの品質管理基準値を記述してください。
  • 画像データまたは生検データの共有に関する同意の制限を記録してください。
  • 保護対象の医療データに用いた匿名化の手法を記載してください。
  • データが請求に応じて提供されるのか、リポジトリでのみ提供されるのかを明記してください。
  • 患者識別子と研究IDとの対応関係を、安全な鍵ファイルで提供してください。
  • データの保管期間と長期保存の計画を記述してください。
データアーカイブに関するよくある質問

データにエンバーゴを設定できますか?

はい。エンバーゴの詳細と公開予定日をお知らせください。

データが専有データである場合はどうすればよいですか?

制限について説明し、アクセスを申請する手順を示してください。

コードの共有は必須ですか?

コードの共有または詳細な説明文書の提供を強く推奨します。

JRDの取り組み

JRDは、呼吸器医学および肺科学における厳密で透明性の高い出版に取り組んでいます。すべての論文種別において、再現可能な臨床手法、診断基準の明確な報告、および倫理的遵守を重視しています。

エディトリアルオフィスは、明確な案内と迅速な対応により、著者、編集者および査読者を支援しています。対象範囲やワークフローに関するご質問は、[email protected]までお問い合わせください。

本誌は報告方法の継続的な改善を奨励し、呼吸器および集中治療の研究において研究コミュニティが高い水準を維持するのに役立つ最新情報を共有しています。

データ共有に関するガイダンスが必要ですか?

リポジトリや許諾に関するご質問は、エディトリアルオフィスまでお問い合わせください。

本ページは英語版ジャーナルページの日本語版です。内容に相違がある場合は、英語版が優先されます。