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目的と対象範囲 Journal of Peptides
Journal of Peptidesは、ペプチド科学全般にわたる査読済みの研究を掲載しています。対象は、化学と合成、構造と機能、生理活性・調節性ペプチド、ペプチドミクスと分析、およびそこから生まれる生物学的応用です。
本誌は、応用分野ではなく研究対象によって定義されます。原稿がペプチドに固有の実質的な科学的問いを扱っている場合、すなわち原稿の貢献がペプチドそのものに関するものである場合、その研究は本誌の対象となります。その貢献は、化学的、構造的、分析的、生物学的、計算科学的、薬理学的、あるいはトランスレーショナルなもののいずれであってもかまいません。
倍率1 · 分子
化学、設計、合成
ペプチドを構築、改変または設計し、その化学が成果となる論文。
- 設計配列設計と合理的改変、ペプチドミメティクス、構造制約型およびステープル化配列、糖ペプチドとコンジュゲート、非天然型・修飾残基、複素環および低分子とのハイブリッド、ライブラリー設計。
- 合成固相法および液相法による合成経路、カップリングと保護基戦略、環化およびライゲーションの化学、樹脂上での修飾、放射性標識、スケール、溶媒選択、より環境負荷の低い手順。
- 精製と同一性クロマトグラフィーによる分離、分析的および分取的手法、そして合成産物が論文に記載された通りのものであることを示すキャラクタリゼーション。
倍率2 · 文脈の中の分子
構造、立体配座、相互作用
配列がとる形、それを決定する要因、そしてその配列が認識する対象に関する論文。
- 立体配座フォールディング、二次構造と構造制約、安定性とダイナミクス、自己集合、ならびに分光学的、結晶学的、質量分析的または計算科学的手法による構造決定。
- 相互作用ペプチド–タンパク質、ペプチド–膜、ペプチド–糖質の認識、受容体結合と選択性、結合の熱力学と速度論、および構造活性相関。
- 分析とキャラクタリゼーションペプチドミクスとプロファイリング、配列決定、定量、電気泳動・クロマトグラフィー・質量分析による分析、ならびに複雑な試料中のペプチドを測定可能にする手法の開発。
- 計算とモデリング構造予測、分子動力学とドッキング、配列および物性のモデリング、データ駆動型設計。実験研究の補助としてだけでなく、それ自体が独立した貢献となるものを対象とします。
倍率3 · 働く分子
活性、機序、応用
生体系や人工物の中でペプチドが果たす働きに関する論文のうち、ペプチドそのものが研究の科学的な中心となっているもの。
- 生理活性・天然ペプチド神経ペプチドおよび調節性ペプチド、ホルモン、抗菌性・宿主防御配列、食品由来・植物由来のペプチド、毒液・分泌物由来のペプチド、ならびにそれらの単離と同定。
- 機能と機序シグナル伝達と受容体活性化、プロセシングと翻訳後修飾、ペプチダーゼの特異性と分解、輸送と細胞内取り込み、および種を横断した比較研究。
- 薬理、有効性、安全性ペプチドに固有の薬理、生体系における活性と選択性、安定性と曝露、忍容性と安全性に関する問い、およびペプチド候補物質の前臨床評価。
- 応用とトランスレーションペプチド材料と自己集合系、送達剤およびイメージング剤、バイオセンシング、バイオテクノロジー・食品・農業への応用、ならびにペプチドそのものが科学的に中心となる治療・トランスレーショナル・臨床関連研究。
境界線の位置
ペプチドに固有の実質的な貢献
二つの問いは区別して扱います。ペプチドが原稿の科学的な中心であるかどうか、そして原稿が示す個々の主張が裏付けられているかどうかです。
対象となるかどうかは、手法ではなく貢献によって決まります。原稿がペプチドに固有の実質的な科学的問いを扱っている場合、すなわち研究が付け加えるものがペプチドに関するものである場合、その原稿は本誌の対象となります。その貢献は、化学的、構造的、分析的、生物学的、計算科学的、薬理学的、トランスレーショナル、あるいは臨床的なもののいずれであってもかまいません。いずれかの種類の貢献に、他の種類の要素が求められることはありません。基礎研究と応用研究は同じ基準で評価されます。
これに応じて、対象外となる範囲は狭く限られます。ペプチドが供給された試薬、比較対照、送達の構成要素、あるいは背景的な詳細といった付随的な存在にとどまり、研究の結論のいずれもペプチドそのものに関するものではない研究が対象外です。
証拠の基準は、原稿が実際に行っている主張に従います。合成経路はそのキャラクタリゼーションによって、構造帰属はそれを決定する測定によって、機序の説明はそれを他と識別する実験によって、有効性や安全性の主張はそうした主張に必要な証拠によって、計算結果はその手法に適した検証によって裏付けられます。本誌は、化学的、構造的、機序的、臨床的、新規性、または実験上の要件を、あらゆる種類の貢献に一律に適用することはありません。
代表的なつながり
各領域は深さの異なる一つの主題
以下の例は説明のためのものです。ある領域の研究が別の領域にどのように及ぶかを示していますが、チェックリストではなく、本誌が検討する対象を限定するものでもありません。
- 合成から立体配座へ実験台で行う保護基や環化の選択が、完成した配列のとりうる立体配座を決定します。そのため、方法論の論文と構造の論文が同じ選択を記述していることも少なくありません。
- 立体配座から機能へ主鎖に構造制約を加えると、親和性、選択性、タンパク質分解への耐性が変化します。構造活性相関の研究が化学と生物学の後ではなく、その間に位置するのはそのためです。
- 機能から応用へ活性についてキャラクタリゼーションされた配列は、材料、プローブ、送達剤やイメージング剤、あるいは治療候補として利用可能になります。そして、そのいずれの用途も化学に新たな問いを投げ返します。
論文種別と投稿
受け付ける論文種別は、研究論文、総説（システマティックレビューを含む）、方法論文、データ／リソース論文、短報です。論説およびパースペクティブ／コメンタリーは依頼によるもののみです。原稿作成の手引きは投稿規定に記載しています。
- 主な投稿経路： ManuscriptZone
- 代替の投稿経路： 簡易原稿投稿フォーム
- サポート付きの投稿経路： [email protected]
著者は、同一の原稿について1つの投稿経路のみを使用しなければなりません。