データアーカイブと許諾International Journal of Cell
IJCは、倫理的・法的義務を守りつつ、再現性と長期的なアクセスを強化するデータアーカイブを支援しています。このページでは、細胞に関するデータ、コード、資料の共有に関する要件を説明します。
本誌のデータアーカイブの方針
可能な限り、データセット、コード、プロトコルを信頼できるリポジトリにアーカイブすることを著者に推奨しています。透明性のあるデータ共有は、科学的誠実性を高め、発見を加速させ、細胞生物学および分子科学における二次解析を支えます。
機密保持、独占的権利による制限または第三者との契約によりデータを共有できない場合、著者は明確な説明を提示し、管理されたアクセスの手続きがあればその内容を記述しなければなりません。
すべての原稿には、何が利用可能か、どこにアーカイブされているか、アクセスにどのような制限があるかを説明する、データの利用可能性に関する声明を含めなければなりません。
主な要件
- すべての論文にデータの利用可能性に関する声明
- 永続的なリンクを備えた信頼できるリポジトリの利用
- 機微なデータや患者データの匿名化
- 可能な場合はコードまたは解析スクリプトの提供
- 測定機器とプロトコルの文書化
- 研究資金提供機関および倫理上の要件の遵守
アーカイブの対象
データセット
細胞代謝の表や速度論的測定値など、細胞に関する知見を裏付ける定量的データセット。
コードとスクリプト
結果の生成に用いた解析スクリプト、統計ワークフロー、計算モデル。
プロトコル
実験方法、アッセイ手順、試料調製の詳細。
構造データ
リポジトリ識別子を付したタンパク質構造、座標、検証指標。
補足表
本文に含まれない詳細な結果、生の出力表および補足図。
メタデータ
コードブック、データ辞書、変数と条件の明確な説明。
許諾とコンプライアンス
細胞生物学研究では、ヒト試料、臨床データ、または独自の試薬を扱う場合があります。アーカイブにあたっては、倫理承認、同意に関する取り決め、法的制約を順守しなければなりません。
識別子を削除し、生体試料データについて倫理委員会の承認に従ってください。
制限付きのデータセットは、所有者の書面による許諾なしに共有しないでください。
外部の共同研究者やベンダーのデータを共有する前に、許諾を取得してください。
再利用の条件と表示の要件を明記した明確なデータライセンスを適用してください。
リポジトリと文書化
永続的識別子、バージョン管理および長期的なアクセスを提供するリポジトリを利用してください。機関リポジトリ、分野別アーカイブ、汎用プラットフォームも、これらの基準を満たしていれば適切な場合があります。
二次利用者がデータを正しく解釈できるよう、アーカイブするファイルにはREADME、データ辞書および明確な引用方法の案内を必ず含めてください。
データへのアクセスが制限されている場合は、連絡先を示し、データ利用契約を含む申請手続きを説明してください。
データの品質とアノテーション
質の高いアノテーションは、再利用性を高め、細胞に関する結果の誤解を防ぎます。著者は、単位、正規化の手順、および生データに適用したあらゆる変換を記録してください。
オミクスのデータセットでは、試料のメタデータ、バッチ識別子、品質管理の出力を含めてください。速度論研究では、アッセイ条件、温度、緩衝液の組成、較正手順を提示してください。
公開後にデータセットを更新する場合、バージョン管理が重要です。改訂を明確に表示し、以前のバージョンへのリンクを維持してください。
アノテーションのチェックリスト
- 単位と測定尺度
- 正規化と前処理の手順
- サンプルのメタデータとバッチID
- 品質管理の指標
- 欠損値の処理
- バージョン識別子と日付
研究資金提供機関の方針との整合
多くの研究資金提供機関は、データ管理計画とリポジトリへの登録を求めています。公開時の遅延を避けるため、早い段階でアーカイブの方法を資金提供機関の要件に合わせてください。
企業から資金提供を受けたプロジェクトや共同プロジェクトについては、データを公開する前に、知的財産に関する条件とエンバーゴ期間の有無を確認してください。早めに計画することで遅延を防ぐことができます。
データの引用は、出典の表示と影響の追跡に不可欠です。推奨される引用文を示し、原稿にデータのDOIまたはアクセッション番号を記載してください。
遵守のための手順
- 資金提供機関のデータ共有方針の確認
- データ管理計画の文書化
- エンバーゴまたはアクセス条件の確認
- データの引用とDOIの提示
- 保存期間の記述
- 所属機関の方針との整合
著者の責任
許諾を確保し、共有するデータが所属機関および法令上の要件を満たすようにする責任は著者にあります。データの利用可能性に関する声明には、リポジトリのリンクとアクセッション番号を記載してください。
データを共有できない場合は、明確な理由を示し、資格のある研究者がアクセスを申請する方法を説明してください。これにより、倫理上の義務を損なうことなく透明性が確保されます。
エディトリアルオフィスはデータ共有の要件に関するご質問にお答えできますが、最終的な指針については、著者が所属の倫理委員会に相談してください。すべての承認を原稿に記載してください。
データアーカイブについてのご案内が必要ですか？
投稿前に、データ共有計画を細胞生物学の倫理および研究資金提供機関の要件に適合させるための支援が必要な場合は、エディトリアルオフィスにご連絡ください。24営業時間以内に返信いたします。
著者ガイドライン エディトリアルオフィスへのお問い合わせメール：[email protected] | 24営業時間以内に回答 | データ共有に関するサポートあり