目的と対象範囲
本誌が扱う問い
Journal of Evolutionary Scienceは、進化の過程とパターンに関する研究、統合、方法、理論を掲載します。すなわち、系統がどのように変化するのか、なぜそのような形で変化するのか、そしてそのような主張がどのように検証されるのかを扱います。本誌の主題は進化に関する問いそのものであり、そのエビデンスがゲノム、集団、化石系列、比較データセット、形式モデルのいずれであっても対象となります。
- ISSN2689-4602
- DOI登録Crossref、プレフィックス10.14302
- 権利CC BY 4.0、著者が著作権を保持
適合性を判断する一つの基準
科学的な適合性は、進化の過程、パターン、概念の理解、またはそれらを研究するための方法、リソース、応用への実質的な貢献に基づきます。この範囲は、基礎研究と応用研究にわたり、生物、集団、比較の文脈を含みます。
配列アラインメント、野生集団、博物館の標本系列、シミュレーション、概念分析は、進化を研究するための異なる方法を提供します。観察研究と実験研究、再現と確認、総説とエビデンスの統合は、いずれも貢献となり得ます。科学的な適合性は研究の進化的な内容によって決まり、エビデンスの質はその方法と主張に照らして評価されます。
原稿は関連する進化研究を踏まえ、結論の根拠を説明してください。確立された説明を確認、精緻化、または批判する研究は、同じ編集上の基準に照らして評価されます。
判断基準
原稿の進化に関する実質的な貢献を明確にし、その問い、解析、リソース、応用がどのようにそれを支えているかを示してください。研究は他の分野にも貢献し得ます。進化への付随的な言及だけでは、科学的な適合性を示すには不十分です。
研究分野
以下の分野は、本誌の科学的な対象範囲を例示するものです。関連する進化の問いや貢献も、上記の対象範囲の中で検討されます。
進化の過程とメカニズム
対立遺伝子と形質の頻度を変化させる力、およびそれらを実際に観察されるパターンと結びつける推論です。
この種の研究選択、遺伝的浮動、突然変異、組換え · エピスタシス、多面発現、制約 · 適応度地形 · 実験進化 · パターンからの過程の推論
集団、種、種分化
集団がどのように分岐するのか、生殖的障壁がどこから生じるのか、そして一つの系統を他の系統から隔てるものは何かを扱います。
この種の研究集団構造と遺伝子流動 · 人口学的歴史 · 生殖的隔離 · 交雑と遺伝子移入 · 種の境界画定 · 保全遺伝学と管理遺伝学
分子進化とゲノム進化
単一のタンパク質ドメインからゲノム全体まで、配列、構造、ゲノム構造に表れる進化を扱います。
この種の研究遺伝子と遺伝子ファミリーの進化 · タンパク質ドメインの保存 · 重複と水平伝播 · 調節領域と非コード領域の進化 · 転移因子 · コドン使用と突然変異バイアス · 微生物とウイルスの進化
系統、比較生物学、地質学的時間
再構築された歴史と、再構築から適切に推論できる事柄を扱います。
この種の研究系統推定 · 分岐年代推定と分子時計モデル · 祖先形質状態の復元 · 比較法 · 生物地理学 · 古生物学と古代DNA · 多様化と絶滅
発生、形態、行動
進化的変化が、生物の構築、形態、ふるまいにどのように表れるかを扱います。
この種の研究進化発生生物学 · 形態、アロメトリー、機能形態 · 生活史の進化 · 行動と性選択 · 共進化と生態的相互作用 · 表現型可塑性
応用進化学
進化の概念、エビデンス、方法を実際的な問題に実質的に応用し、その解析と解釈における役割を明確にした研究です。
この種の研究保全遺伝学と復元遺伝学 · 病原体、媒介生物、薬剤耐性の進化 · 家畜化・栽培化、育種、作物と家畜の系統 · 健康と疾患に関する進化的視点 · 侵入とバイオセキュリティ
方法、モデル、研究リソース
進化に関する問いに答えることを可能にする貢献で、他の研究者に何を可能にするかに基づいて評価されます。
この種の研究推論手法と統計モデル · シミュレーションフレームワーク · ソフトウェアと解析パイプライン · キュレーションされた配列、表現型、系統のリソース · ベンチマークと再現性
理論、概念、分野の歴史
進化の過程の形式的な取り扱いと、進化に関する主張が何を述べているのかの分析です。
この種の研究進化の過程の形式モデル · 複雑性と組織化の尺度 · 進化に関する概念と用語の分析 · 進化科学の歴史と哲学
著者からのよくある質問
以下の質問では、科学的な適合性と、さまざまな貢献の評価について説明します。
01
私の貢献は理論的なものです。掲載の対象になりますか？
対象になります。進化の過程のモデル、組織化と複雑性の形式的な取り扱い、進化に関する主張が何を述べているのかの分析は、実証研究と並んで、本誌では一次研究として読まれます。理論的な原稿では、その前提、推論または導出、および進化科学との関連性を説明してください。主張に該当する場合は、実証的な含意と検証についても論じてください。
02
私の結果は確立された見解に反しています。
それは対象範囲ではなく、エビデンスに関する問題です。本誌は論証する研究を掲載し、合意を揺るがす主張にも、それを確認する主張と同じ基準を適用します。主張を明確に述べ、その根拠を示し、修正しようとする見解の最も強い形と向き合ってください。そのように示された論証には応答することができ、それこそがこの分野にとっての有用性となります。
03
貢献は知見ではなく、方法またはリソースです。
方法、モデル、パイプライン、キュレーションされたデータセットは、進化研究を支えることで貢献となり得ます。その目的、関連する比較または検証、そして研究者がどのように利用できるかを説明してください。貢献とその主張に応じて、裏付けとなるデータ、シミュレーション、導出、またはリソースの文書を提供してください。
04
私の研究は進化科学と別の分野の間に位置しています。
生態学、発生学、ゲノミクス、疫学、古生物学、統計学、科学史などとの境界にある研究は、進化科学に実質的な貢献をする場合に対象範囲に含まれます。研究課題、アプローチ、または解釈において、各分野がどのようにつながるかを説明してください。
05
どの程度のエビデンスがあれば十分ですか？
エビデンスの強さは、行われる主張に見合ったものである必要があります。記述的研究や観察研究は、それ自体の前提に立って進化に関する問いに取り組むことができますが、因果的な主張には因果推論に適したエビデンスが必要です。対象範囲への適格性とエビデンスの質は、以下の編集上の基準とあわせて、別々に評価されます。
原稿で明確にすべきこと
これらの科学的な要件は、貢献に関連する範囲で適用されます。本誌の原稿作成に関するガイダンスについては、投稿規定をご参照ください。
- 主張
- 原稿が何を主張し、その主張がどこまで及ぶのかを早い段階で述べてください。読者が、その主張が成り立つためには何が真でなければならないかを言えるようにしてください。
- 主張に至る道筋
- 解析を再現できるように報告してください。データの出典、ソフトウェアとそのバージョン、モデルの選択、事前分布、パラメータなど、結果を左右する要素はすべて記載してください。
- 主張を支えるエビデンス
- 解析を検証し、発展させることができるよう、データ、アラインメント、系統樹、コード、シミュレーションを、本誌の編集方針に定める条件で利用可能にしてください。
- 方法に応じて求められる報告
- 較正点と分子時計モデル、有効集団サイズとその不確実性、標本と産地の来歴、統計的診断などの専門的な報告要件は、研究で実際に用いる方法に適用されます。
適合性の判断方法
すべての投稿は、編集部による初期審査を受けます。本ジャーナルの対象範囲と最低要件を満たす原稿は、独立した査読に進みます。
外部査読に進む原稿は、通常、少なくとも2名の当該分野の独立した専門家によって評価されます。査読者には、エビデンスが主張を裏付けているか、解析を再現できるように方法が適用・報告されているか、原稿が関連文献を踏まえているかを評価するよう求めます。
編集上の決定は、対象範囲、科学的な質、方法論の厳密さ、倫理の遵守、報告の質、および本誌との関連性に基づいて行われます。これらの決定は、料金、サービス、メンバーシップ、編集上の役職とは独立しています。編集者または査読者が本誌に研究を投稿した場合、その原稿は本人から独立して取り扱われます。
- 正式名称
- Journal of Evolutionary Science
- ISSN
- 2689-4602
- DOI登録
- Crossref、プレフィックス 10.14302
- 査読
- 標準ではシングルブラインド方式。要望に応じてダブルブラインド方式の査読も利用できます。
- 権利
- CC BY 4.0、著者が著作権を保持
本誌への投稿
上記の基準を満たす原稿は、年間を通じて受け付けています。投稿には3つの方法があり、いずれも同じエディトリアルオフィスに届きます。
- 主な投稿方法
- ManuscriptZone
- 代替の投稿方法
- 原稿投稿フォーム（Journal of Evolutionary Scienceが選択された状態で開きます）。
- サポート付きの投稿方法
- エディトリアルオフィス（[email protected]）。
著者は、同一の原稿について1つの投稿経路のみを使用しなければなりません。