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データアーカイブと共有
がん研究における透明性と再現性を推進します。
オープンデータががんの発見を加速する
JNは、公表された知見の基盤となる腫瘍学研究データが、出版物そのものと同様に価値あるものであると考えています。本誌は著者にデータのオープンな共有を求めており、それによって再現性を可能にし、がん科学の進歩を加速します。
データの利用可能性に関する方針
必須
ゲノムデータ
- シーケンスデータはGEO/ArrayExpress/EGAへ
- アクセッション番号が必要
- 論文出版時に公開
- 完全なメタデータの提出
- 患者データの制限付きアクセス
必要
臨床試験データ
- 個々の患者データの共有計画
- ClinicalTrials.govへの登録
- プロトコルの利用可能性
- 統計解析計画
- 匿名化の基準
推奨
補足データ
- 生の画像データと測定値
- 解析コードとスクリプト
- 抗体のバリデーションデータ
- Dryad、Zenodo、またはFigshare
- 引用のためのDOI付与
がん研究に特化したリソース
TCGA/GDCとの統合
TCGAデータを用いた研究は適切に引用し、がんゲノミクスデータの統合に関するGDCガイドラインに従って補完的なデータを登録してください。
細胞株の認証
すべてのがん細胞株についてSTRプロファイリングの結果を報告してください。新規細胞株は、認証データとともにATCCなどの公認リポジトリに寄託してください。
生体試料の共有
共同でのがん研究を可能にするため、検証済みのPDXモデル、オルガノイド、希少腫瘍検体のバイオバンクへの寄託をご検討ください。
コードリポジトリ
解析コードはバージョン管理のもとでGitHubに登録してください。再現性を確保できるよう、ドキュメントとサンプルデータセットを含めてください。
患者のプライバシー： 機微な患者情報を含む腫瘍学データセットについては、dbGaP、EGA、または機関のデータ共有契約を通じた制限付きアクセスにより、プライバシーを保護しつつ透明性の要件を満たします。
オープンながん科学への貢献
データを共有し、がん克服に向けた進歩を加速させましょう。