In-vitro In-vivo In-silico Journal

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  • データと許諾
  • オープンアクセス · CC BY 4.0

データアーカイブと許諾

In-vitro In-vivo In-silico Journalが著者に求めている、研究結果の根拠となるデータ、コードおよびモデルの共有、研究参加者の保護、ならびに再利用する素材の許諾取得について説明します。

概要

概要

著者向けの要点です。各項目の詳細は以下に記載しています。

データの利用可能性に関する声明

すべての実証研究の原稿に必須です。

リポジトリ

永続的識別子を備えた公認リポジトリへのデポジットを推奨します。

コードとモデル

解析コード、計算モデルおよびカスタムソフトウェアは、可能な限り共有されます。

参加者データ

個人を特定できない形(非識別化した形)でのみ、かつ得られた同意および倫理承認の範囲内でのみ共有されます。

転載資料

著作権者からの書面による許諾を、投稿時に提出します。

保存

本誌のコンテンツはPorticoに登録される予定です。

全文

データアーカイブと許諾の詳細

データの利用可能性に関する声明

すべての実証研究の原稿には、データの利用可能性に関する声明を含めます。この声明では、結果を裏付けるデータの入手先、または倫理審査の承認、同意もしくは第三者の権利によって共有が制限される場合にデータにアクセスできる条件を説明します。典型的な記載例は次のとおりです:

  • リポジトリでのデータ公開:「本研究の結果を裏付けるデータは、[リポジトリ]の[DOIまたはURL]で公開されています。」
  • 請求に応じたデータ提供:「本研究の結果を裏付けるデータは、合理的な請求があれば責任著者から入手できます。」
  • 制限付きデータ:「[倫理上、プライバシー上、法律上または財産権上の制約]によりデータは公開されていませんが、データ使用契約に基づき責任著者から入手できます。」
  • 論文内のデータ:「本研究で生成または解析されたすべてのデータは、本論文およびその補足ファイルに含まれています。」

リポジトリの選択

データは、DOIやアクセッション番号などの永続的識別子を付与し、FAIR原則に沿ったメタデータに対応する、分野別または汎用のリポジトリに登録します。例は次のとおりです。

  • 一般:Zenodo、Figshare、Dryad、Open Science Framework
  • 化学・生理活性:PubChem、ChEMBL、Cambridge Structural Database
  • 構造・配列:Protein Data Bank、GenBank、UniProt
  • オミクス・発現:Gene Expression Omnibus、ArrayExpress、PRIDE、MetaboLights
  • 計算モデル:BioModels

コード、モデルおよびソフトウェア

結果の算出に使用したカスタムコード、スクリプト、ドッキングおよびシミュレーションの入力データ、学習済みモデルならびにソフトウェアは、可能な限り、例えばZenodo、GitHubまたはGitLabを通じて共有されます。その際には、バージョン番号、パラメータ、乱数シード、学習用・テスト用のデータ分割、依存関係、および解析を再現するのに十分なドキュメントを併せて提供します。

動物研究および実験室研究

著者は、実験を評価・再現できるよう、材料、試薬、細胞株、動物の系統と数、無作為化と盲検化、および各図の基となる生データを報告します。動物を対象とする研究は、ARRIVEガイドラインに従って報告されます。

ヒトを対象とする研究の参加者とプライバシー

ヒト参加者のデータは、参加者の同意および当該研究の倫理審査の承認と整合する場合にのみ共有されます。共有の前に、著者は参加者を特定し得る情報を削除し、完全な匿名化が不可能な場合はアクセス制限付きリポジトリを使用し、GDPRやHIPAAなどの適用されるデータ保護法に従います。

個人を特定できる画像や詳細な症例情報は、本人または法定後見人から掲載について書面によるインフォームド・コンセントを得た場合にのみ掲載されます。

二次データ

既存のデータセットや化合物ライブラリを解析する著者は、元のデータソースを引用し、データ提供者が定める利用条件に従い、データ作成者への謝辞を記し、読者が同じデータを入手する方法を説明します。

出版済み資料の再利用の許諾

他所で発表された図、表または相当量の本文を転載する原稿には、著作権者(通常は元の出版社)からの書面による許諾が必要です。著者は投稿時に許諾を提出し、キャプションに出典を記載します(例:「[引用]より許諾を得て改変」)。CC BYのもとで公開された素材は、クレジット表示が必要ですが、通常は許諾は不要です。

IIIJの論文はCC BY 4.0の下で公開されているため、著作権・ライセンスのページに記載のとおりクレジットを表示すれば、許諾を求めることなく再利用できます。

補足資料

拡張表、スペクトル、データセット、動画などの補足ファイルの提出を歓迎します。各ファイルには、例えば「Supplementary_Table_1.xlsx」のように分かりやすい名前を付け、原稿中で簡潔に説明してください。補足資料は原稿とともに査読されます。非常に大きなファイルについては、投稿前にエディトリアルオフィスにご連絡ください。

質問

データ共有または許諾に関するご質問は、エディトリアルオフィス([email protected])までお寄せください。

関連する方針

関連ページ

本ページは英語版ジャーナルページの日本語版です。内容に相違がある場合は、英語版が優先されます。

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