目的と対象範囲
目的と対象範囲
本誌の扱う領域は、誌名の両方の要素から定められています。本誌は、バイオインフォマティクス、糖尿病および関連する代謝科学、そして計算科学的アプローチとこれらの疾患を結びつける研究への実質的な寄稿を審査の対象とします。各領域はそれ自体で対象となり、両者の結びつきは歓迎しますが、必須ではありません。
- ISSN 2374-9431
- 出版社 Open Access Pub
- アクセス オープンアクセス
- 査読 査読あり
対象分野
Journal of Bioinformatics and Diabetesは、相互に関連する二つの領域にわたる査読付きの研究を掲載します。一つは計算科学的・データ駆動型の生物学(ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームおよびメタボロームの解析、システムモデリング、アルゴリズム、データベースと機械学習)、もう一つは糖尿病および関連する代謝疾患の生物学、治療と合併症です。以下に示す範囲はアーカイブではなく本誌が定めるものであり、原稿が本誌にふさわしいかどうかを著者が執筆前に判断できるよう示しています。
計算科学的・データ駆動型の生物学
- ゲノミクスと遺伝的変異
- 配列解析、バリアントのアノテーションと機能予測、関連解析、ポリジェニック手法と集団遺伝学的手法。
- トランスクリプトミクスとエピゲノミクス
- 発現解析、制御エレメントとメチル化の研究、ノンコーディングRNA、そしてシングルセル解析のアプローチ。
- プロテオミクスとメタボロミクス
- タンパク質と代謝物のプロファイリング、構造解析、そして質量分析データおよび関連データの処理。
- システム生物学とモデリング
- 代謝とシグナル伝達の経路モデル、ネットワークモデルおよび制約ベースモデルと、それらの検証に用いられるエビデンス。
- 統計学と機械学習
- アルゴリズム、統計的方法論、予測モデルと分類モデル、そして生物学的データにおけるそれらの検証。
- リソースと再現性
- 他のグループが実行できるように記述されたデータベース、オントロジー、データ標準、アノテーションおよび解析ワークフロー。
糖尿病と代謝科学
- メカニズム
- インスリンの産生と作用、グルコース代謝、酸化ストレス、そして糖尿病が発症する分子過程。
- 病型と合併症
- 1型、2型および妊娠糖尿病、前糖尿病、そして眼、腎臓、神経、血管および生殖系にわたる合併症。
- 栄養学と薬理学
- 実験的または臨床的に検討された栄養素、化合物および治療法。使用したモデル、用量および条件とともに報告されるもの。
- 測定と診断
- 代謝疾患における測定法、モニタリング技術、診断研究および臨床研究。
- ケアとアウトカム
- 問いが糖尿病と代謝の健康に関わる場合の、自己管理、ヘルスサービスおよびインフォマティクスの研究。
本誌が審査の対象とするエビデンス
主題として対象となるかどうかは、原稿が立てる問いによって決まります。結論がどこまで及ぶかは、それとは別に、原稿が示すエビデンスによって決まります。
- i手法の開発やアルゴリズムに関する寄稿を含む、基礎的・理論的研究。
- ii既存のデータまたは新たに生成されたデータの計算科学的・解析的研究。
- iii細胞モデルや動物モデルを用いた研究を含む、実験室研究と実験的研究。
- iv糖尿病および代謝疾患における臨床研究、疫学研究およびヘルスサービス研究。
- v機序、モデルまたはデータセットを実践に結びつけるトランスレーショナル研究。
- vi既に報告された知見をまとめ、評価する研究。
原稿は、新規の計算手法を含むことも、臨床的介入を報告することも求められません。求められるのは、上記の領域に属する問いを立て、その主張に適したエビデンスによってその問いに答えることです。
対象となるかどうかと主張は別々に判断されます
すべての投稿について二つの問いが検討され、それらは同じ問いではありません。
主題は対象範囲に含まれるか
これは上記の扱う領域によって決まります。インスリンシグナル伝達の研究、バリアントアノテーションのデータベース、糖尿病モデルにおける食事由来化合物の試験、そして測定法の総説は、いずれも対象となる主題です。
エビデンスは主張を裏付けているか
これは査読において判断されます。編集上の判断は、対象範囲、科学的な質、方法論的な厳密さ、倫理の遵守、報告の質、および本誌との関連性に基づいて行われます。
査読の内容
すべての投稿は、編集部による初期審査を受けます。本ジャーナルの対象範囲と最低要件を満たす原稿は、独立した査読に進みます。
標準ではシングルブラインド方式。要望に応じてダブルブラインド方式の査読も利用できます。
対象範囲外となるもの
バイオインフォマティクス、糖尿病または代謝科学と実質的な関連のない研究は、示されたエビデンスでは結論を裏付けることができない研究と同様に、スクリーニングの段階で返却されます。
原稿の種類
依頼によらない投稿を受け付けている論文種別は7種類です。種別は寄稿の形式を表すものであり、主題の範囲は上記のとおりです。
- 研究論文
- 独自の研究の完全な報告。問い、行ったこと、見出したこと、そしてそこから導かれること。
- 総説
- 明確に定めた問いに関する既発表研究の批判的な統合。エビデンスが強い点と乏しい点を示すもの。
- システマティックレビューとメタアナリシス
- 明示したプロトコルに沿って実施されたレビュー。検索、研究の選択、そして該当する場合は定量的統合を報告するもの。
- 方法論文
- 新規の、または大幅に改良された手法、アルゴリズム、解析パイプラインまたは実験プロトコル。他のグループが適用できるように記述されたもの。
- データ/リソース論文
- データセット、データベース、ソフトウェアツールまたはその他のリソース。それがどのように作成され、どのように再利用できるかとともに記述されたもの。
- 短報
- それ自体で成り立つ知見の簡潔な報告。
- 症例報告
- 臨床症例または小規模の症例シリーズ。それが示す内容のために提示されるもの。
論説とパースペクティブ/コメンタリーは、編集者が依頼するものです。これらは、依頼によらない通常の投稿区分には含まれません。
バイオインフォマティクスまたはデータ指向の原稿は、対象となるために糖尿病の要素を含む必要はなく、糖尿病または代謝に関する原稿は、新しい計算手法を含む必要はありません。いずれも、本誌の扱う領域の中で、それ自体の基準で評価されます。
Journal of Bioinformatics and Diabetes · ISSN 2374-9431 · 発行:Open Access Pub