ジャーナルについて
Journal of Bioinformatics and Diabetesについて
糖尿病は、二つのスケールで同時に研究されています。一つは公開リポジトリに保管された配列、発現および代謝物のデータにおいて、もう一つは生体系で代謝が測定される実験室と臨床の場においてです。
Journal of Bioinformatics and Diabetesは、いずれかのスケールでの丁寧な研究、そして両者を結びつける研究を、同じ場所で掲載し、読み、引用できるようにするために存在します。
- ISSN 2374-9431
- 出版社 Open Access Pub
- アクセス オープンアクセス
- 査読 査読あり
ひとつの問いの二つの側面
本誌の扱う領域は誌名によって定められており、誌名の二つの要素は同等の重みを持ちます。
バイオインフォマティクスは、大規模な生物学的データセットを扱えるようにする手法を提供します。すなわち、配列解析と構造解析、発現プロファイリングと代謝物プロファイリング、ネットワークモデルとシステムモデル、統計的手法と機械学習の手法、そしてそれらを保持するデータベースとワークフローです。糖尿病は、それとは別の生物学的・臨床的な問いを提供します。また、データ駆動型の手法が代謝研究を前進させるとき、二つの分野は交わります。
それぞれの側面は、その分野自体の基準で読まれます。計算科学的な寄稿は、その手法が再現できるほど十分に記述されているか、そしてその結果が選択された生物学的な設定において何を立証しているかという観点から読まれます。実験的または臨床的な寄稿は、そのデザイン、測定、そしてそれらが成り立つ条件という観点から読まれます。両者を結びつける研究は本誌の中心に位置し、いずれか一方を強化する研究も本誌にふさわしいものです。
この幅広さは意図的なものです。糖尿病研究は、バリアント、転写産物、経路、膵島、臓器、そして一人の人間というように、スケールの間を行き来します。本誌は、その範囲全体を扱えるように構成されています。
01
データの側面
ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボローム、それらに適用されるアルゴリズム、統計的手法およびモデル、そして解析を再実行できるようにするデータベース、標準およびワークフロー。
02
生物学の側面
インスリンの産生と作用、グルコース代謝と酸化ストレス、1型、2型および妊娠糖尿病、栄養学、薬理学と実験的治療学、そして糖尿病が影響を及ぼす臓器と組織。
03
両者が交わる領域
機序に照らして読み解かれるデータセット、測定に照らして検証されるモデル、一方の領域で立てられ、もう一方の領域で検討される問い。
本誌が掲載する内容
本誌の誌名が扱う主題全般にわたる査読付きの研究。
- データとその手法
- ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームおよびメタボロームのデータの解析と、それに適用されるアルゴリズム、統計的手法および機械学習の手法。
- 生物学的システムのモデル
- 代謝とシグナル伝達の経路モデル、ネットワークモデルおよびシステムモデル、ならびにそれらが依拠する仮定と、それらの検証に用いられるエビデンス。
- リソースと再現性
- 他のグループが実行できるように記述されたデータベース、データ標準、アノテーションおよび解析ワークフロー。
- 機序と測定
- インスリンの産生と作用、グルコース代謝、酸化ストレス、そして糖尿病が発症する分子過程。
- 糖尿病の病型
- 1型、2型および妊娠糖尿病と、それらに続いて臓器や組織に生じる合併症。
- 栄養学、薬理学と治療学
- 実験的または臨床的に検討された栄養素、化合物および治療法。使用したモデル、用量および条件とともに報告されるもの。
- 診断と臨床研究
- 糖尿病および関連する代謝疾患における測定、診断および臨床研究。
掲載済みの論文はこの扱う領域を例示するものです。原稿は、上記の対象範囲と以下の基準に照らして評価されます。
本誌の読者
読者と寄稿者は大部分が同じ人々であり、ひとつの主題に異なる手段で取り組んでいます。
本誌は、分野の境界を越えて文献を読む研究者に向けたジャーナルです。主な手段がシーケンサー、質量分析計、動物実験施設または臨床の場であり、他の人々が見出したことを追う必要がある方々です。
そのいずれの方にも求められることは同じです。明確に述べられた問い。検討できるほど十分に記述された手法またはモデル。得られた条件とともに報告された結果。そして、その条件が許す範囲を超えない結論です。
- i代謝に関する問いに取り組む計算生物学者、バイオインフォマティシャンおよびデータサイエンティスト。
- iiインスリン、グルコース処理および影響を受ける組織を研究する遺伝学者、分子生物学者および細胞生物学者。
- iii栄養学、薬理学および実験的治療学の研究グループ。
- iv糖尿病および代謝疾患の臨床研究者と大学院生の研究者。
編集責任の実際
査読は、主張が記録に加わる前に、それを単なる断言と区別するための仕組みです。以下がその運用条件です。
初期審査と査読
すべての投稿は、編集部による初期審査を受けます。本ジャーナルの対象範囲と最低要件を満たす原稿は、独立した査読に進みます。
標準ではシングルブラインド方式。要望に応じてダブルブラインド方式の査読も利用できます。
評価
外部査読に進む原稿は、通常、少なくとも2名の独立した専門家によって評価されます。
編集上の判断は、対象範囲、科学的な質、方法論の厳密さ、倫理面の遵守、報告の質、および本ジャーナルとの関連性に基づいて行われます。
独立性
編集上の判断は、料金、メンバーシップ、編集上または査読上の役職、および出版社が提供するあらゆる有料サービスから独立しています。
編集者は自身の投稿に関する決定には関与しません。それらの原稿は独立して取り扱われます。
Journal of Bioinformatics and Diabetes · ISSN 2374-9431 · 発行：Open Access Pub