データアーカイブと許諾

データの利用可能性に関する声明

すべての実証研究の原稿には、データの利用可能性に関する記載を含めます。この記載では、結果を裏付けるデータの所在、または倫理承認や参加者の同意により共有が制限される場合にはデータにアクセスできる条件を説明します。一般的な記載例は以下のとおりです：

• リポジトリでのデータ公開：「本研究の結果を裏付けるデータは、[リポジトリ]の[DOIまたはURL]で公開されています。」
• 請求に応じたデータ提供：「本研究の結果を裏付けるデータは、合理的な請求があれば責任著者から入手できます。」
• 制限付きデータ：「[倫理上、プライバシー上または法的な制約]のためデータは公開されていませんが、データ使用契約に基づき責任著者から入手できます。」
• 論文内のデータ：「本研究で生成または解析されたすべてのデータは、本論文およびその補足ファイルに含まれています。」

リポジトリの選択

データは、DOIやアクセッション番号などの永続的識別子を付与し、FAIR原則に沿ったメタデータに対応する、分野別または汎用のリポジトリに登録します。例として、汎用リポジトリ（Zenodo、Figshare、Dryad、Open Science Framework、Harvard Dataverse）、配列リポジトリ（GenBank、European Nucleotide Archive、DDBJ、Sequence Read Archive）、および寄生虫と媒介生物のゲノムデータを扱うVEuPathDBがあります。

配列と標本

新規の塩基配列およびタンパク質配列は投稿前にGenBank、European Nucleotide ArchiveまたはDDBJに登録し、論文中にアクセッション番号を記載します。形態または配列に基づく種の同定については、その方法を記載し、可能な場合は参照標本を公認の博物館、コレクションまたはバイオバンクに寄託し、論文中にカタログ番号を記載します。

コードとソフトウェア

結果の作成に使用した独自コード、統計解析スクリプトおよびソフトウェアは、可能な範囲で、例えばZenodo、GitHubまたはGitLabを通じて、バージョン番号、依存関係、および解析を再現するのに十分なドキュメントとともに共有します。

ヒトを対象とする研究の参加者とプライバシー

ヒトの研究参加者から得たデータは、参加者の同意および研究の倫理承認と矛盾しない場合に限り共有します。共有する前に、著者は参加者を特定し得る情報を削除し、完全な匿名化が不可能な場合はアクセス制限付きリポジトリを使用し、適用されるデータ保護法に従います。個人を特定できる画像や詳細な症例情報は、本人または法定後見人から公表についての書面によるインフォームド・コンセントを得た場合に限り掲載します。

二次データ

既存のデータセットを解析する著者は、元のデータソースを引用し、データ提供者が定める利用条件に従い、データ作成者への謝辞を記し、読者が同じデータを入手する方法を説明します。

出版済み資料の再利用の許諾

他所で発表された図、表または相当量の本文を転載する原稿には、著作権者（通常は元の出版社）からの書面による許諾が必要です。著者は投稿時に許諾を提出し、キャプションに出典を記載します（例：「[引用]より許諾を得て改変」）。CC BYのもとで公開された素材は、クレジット表示が必要ですが、通常は許諾は不要です。

JPARの論文はCC BY 4.0の下で公開されているため、著作権・ライセンスのページに記載のとおりクレジットを表示すれば、許諾を求めることなく再利用できます。

補足資料

拡張した表、質問票、データセット、アラインメント、動画などの補足ファイルの提出を歓迎します。各ファイルには「Supplementary_Table_1.xlsx」のように分かりやすい名前を付け、原稿中で簡潔に説明してください。補足資料は原稿とともに査読されます。非常に大きなファイルについては、投稿前にエディトリアルオフィスにご連絡ください。

質問

データ共有または許諾に関するご質問は、エディトリアルオフィス（[email protected]）までお寄せください。